wordpress0.3.3のXOOPSモジュールを使わせてもらっています。
自分の記事あてにTrackbackのテストをしてみたのですが、
Trackbackのカウントがコメントのカウントになってしまいます。
つまりトラックバックはコメントとして展開されてしまっているようです。
『コメント（１）』という具合に…
同様に、結果がトラックバック一覧ではなく、
コメント一覧に反映されてしまいます。（最近のコメント欄にも）
デフォルトの時から『Trackback（０）』という表示がトップページにもエントリーページも
表示されていなかったような気がします…
レイアウト（CSS)を結構いじってしまったのが原因でしょうか？

引用：

yukさんは書きました：
wordpress0.3.3のXOOPSモジュールを使わせてもらっています。
自分の記事あてにTrackbackのテストをしてみたのですが、
Trackbackのカウントがコメントのカウントになってしまいます。
つまりトラックバックはコメントとして展開されてしまっているようです。
『コメント（１）』という具合に…
同様に、結果がトラックバック一覧ではなく、
コメント一覧に反映されてしまいます。（最近のコメント欄にも）
デフォルトの時から『Trackback（０）』という表示がトップページにもエントリーページも
表示されていなかったような気がします…
レイアウト（CSS)を結構いじってしまったのが原因でしょうか？

WordPressでは、コメントとトラックバックは同等の扱いとなっています。
よって、 yukさんのご指摘どおりの現象となるのが正常です。